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第1章　海洋环境中的微生物1

1　海洋微生物及其多样性2

2　生物的基本结构和生命的进化4

3　海洋微生物的大小8

4　海洋微生物的主要特征10

5　海洋环境及其理化因素17

6　海洋微生物的栖息环境21

参考文献28

第2章　海洋原核生物的结构与生物学特性29

1　海洋原核细胞的形态结构29

2　原核生物的一般构造及特性30

3　原核生物的特殊构造及特性38

4　营养方式及能量产生过程44

5　生长及营养物质49

6　极端环境条件下的海洋原核生物60

参考文献66

第3章　海洋细菌68

1　细菌分类系统68

2　海洋细菌的多样性和主要类群72

3　不产氧的光合细菌（Anoxygenic phototrophic bacteria）75

4　产氧的光合细菌——蓝细菌（Cyanobacteria）78

5　化能自养菌（Chemolithotrophs）81

6　假单胞菌属（Pseudomona）、交替单胞菌属（Alteromonas）和希瓦氏菌属（Shewanella）85

7　肠杆菌科（The Enterobacteriaceae）85

8　弧菌科（Vibrionaceae）86

9　立克次氏体（Rickettsia）102

10　螺旋菌（Spirilla）102

11 出芽的和有柄的变形菌门细菌（Budding and stalked Proteobacteria）106

12 浮霉菌门（Planctomycetes）——有柄的细菌107

13　变形菌门中的硫和硫酸盐还原细菌107

14　革兰氏阳性菌（Gram-positive bacteria）108

15 噬纤维菌属-黄杆菌属-拟杆菌属组（The Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides group,CFB group）111

16　疣微菌门（Verrucomicrobia）111

17　螺旋体门（Spirochaetes）112

18　深度分支的极端嗜热菌（Deeply branching hyperthermophile）112

参考文献113

第4章　海洋古菌116

1　古菌域（Archaea）的系统发生类群116

2　广域古菌门（Euryarchaeota）119

3　泉生古菌门（Crenarchaeota）123

4　初生古菌门（Korarchaeota）127

5　纳米古菌门（Nanoarchaeota）127

6　海洋古菌的互养共栖（syntrophic）关系128

参考文献129

第5章　海洋真核微生物131

1　真核微生物主要类群131

2　真核细胞的结构和功能132

3　原生动物（Protozoan）134

4　真核微藻类138

5　海洋真菌（Fungi）143

参考文献145

第6章　海洋病毒147

1　海洋病毒在海水中的存在148

2　海洋病毒的形态及病毒感染细胞的观察149

3　病毒和似病毒粒子的计数150

4　病毒失活152

5　病毒的宿主专一性及溶源性（lysogeny）153

6　感染海洋浮游生物的病毒155

7　感染海水养殖动物的病毒157

参考文献160

第7章　海洋微生物在海洋生态系统中的作用162

1　海洋微生物学观点上的重要改变162

2　海洋微生物在生物地球化学循环中的作用164

3　生产力167

4　海洋食物链中的微食物环172

5　微生物在近岸海水富营养化（eutrophication）中的作用178

6　微生物的活动和气候178

参考文献179

第8章　海洋环境中活的非可培养（VBNC）状态细菌181

1　VBNC状态细菌的发现182

2　诱导细菌进入VBNC状态的环境因素186

3 VBNC状态细菌的生物学特性189

4 VBNC状态病原菌的致病性192

5 VBNC状态细菌的复苏研究193

6　细菌进入VBNC状态的内在机制195

7 VBNC状态细菌的检测方法195

8　对细菌VBNC状态概念的争议199

9　细菌VBNC状态的理论及实际意义199

参考文献203

第9章　鱼类的微生物病害206

1　病害诊断207

2　细菌性传染病208

3　病毒性传染病218

4　鱼类传染性病害的控制221

参考文献237

第10章　海洋微生物的利与弊239

1　有益菌在海水养殖中的应用240

2　海洋微生物产生的活性物质262

3　海洋污染物的生物降解和生物修复268

4 海洋微生物在生物附着（bioattachment）中的作用271

5　生物污损（biofouling）和防污损（antifouling）274

6 金属的微生物腐蚀（microbiofouling corrosion）277

7　微生物及其共生动物对木材的腐损（decay）281

参考文献281

第11章　海洋微生物的采样技术284

1　水样的采集284

2　泥样的采集290

3　检样的贮存291

参考文献292

第12章　海洋细菌的定性和定量检测技术293

1　显微镜镜检计数法294

2　培养计数法302

3　免疫学检测法305

4　分子生物学方法307

5　分子生物学和免疫学结合的方法311

参考文献312

第13章　海洋微生物的分离与培养技术315

1　海洋异养细菌的分离与培养315

2　海洋弧菌的分离与培养317

3　海洋蓝细菌的分离与培养318

4　海洋硫杆菌的分离与培养320

5　光合细菌的分离与培养322

6　海洋硝化细菌的分离与培养323

7　石油降解菌的分离与培养324

8　海洋发光细菌的分离与培养325

9　海洋甲基营养菌（rnethylotrophs）的分离与培养326

10　海洋螺旋体的分离与培养327

11　海洋噬纤维菌（Cytophaga sp．）的分离与培养327

12　海洋固氮菌的分离与培养328

13　海洋放线菌的分离与培养328

14　海洋酵母菌的分离与培养329

15　其他常见海洋微生物培养基配方329

16　海洋微生物培养新技术331

17　海洋微生物的保存方法333

参考文献335

第14章　海洋细菌的分类与鉴定技术337

1　海洋细菌主要生理生化特征的鉴定方法338

2　数值分类学及其在细菌鉴定中的应用346

3　几种常用细菌快速鉴定系统及其应用347

4　海洋细菌的基因特征分类法349

5　展望351

参考文献352

附录Ⅰ 常见海洋原核微生物名称索引355

附录Ⅱ 常见海洋微生物名词索引363