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第1章　文献综述1

1　遗传标记的发展1

2　水稻遗传连锁图谱的构建3

2.1 水稻经典遗传图谱3

2.2　水稻分子连锁图谱4

2.3 经典图谱和分子图谱的整合以及分子图谱之间的比较研究5

3　水稻和其它禾谷类作物基因组的比较研究6

4　水稻基因定位和克隆研究9

4.1 质量性状基因定位9

4.2　数量性状基因定位14

4.3　基因克隆17

5 分子标记在水稻育种中的应用18

5.1 育种资源的鉴别和利用18

5.2　杂交育种中亲本选配19

5.3　分子标记辅助选择20

5.4　杂种优势的遗传基础和预测21

5.5 构建优良品种的指纹图谱22

5.6 作物育种对分子标记的要求23

第2章 水稻温敏显性核不育和隐性长生育期基因的遗传分析和分子标记定位25

1 引言25

2.1 供试材料26

2　材料和方法26

2.2　试验方法27

3 结果分析31

3.1　8987不育基因的遗传分析31

3.2　8987的温光反应和生育期的遗传分析33

3.3　亲本多态性检测和2个基因的连锁分子标记筛选35

3.4　温敏显性核不育和隐性长生育期基因的定位35

4　讨论37

4.1 关于显性核不育基因的遗传和定位37

4.2　水稻生育期基因的遗传和等位研究38

1 引言40

第3章 籼稻品种地谷抗稻瘟病基因的遗传分析和定位40

2　材料和方法41

2.1　植物材料41

2.2　供试菌系和菌液制备42

2.3　人工接种鉴定42

2.4　RFLP检测、微卫星标记分析和遗传作图43

3 结果分析43

3.1 地谷抗稻瘟病基因的遗传分析43

3.2　地谷抗稻瘟病基因和已知抗病基因等位性测定44

3.4 亲本近等基因池的RFLP和微卫星标45

记分析45

3.3　抗感病近等基因池的构建45

3.5　地谷稻瘟病抗性基因的定位46

4　讨论47

第4章 利用分子标记鉴定水稻稻瘟病抗性和分子标记辅助育种49

1 引言49

2　材料和方法50

2.1 植物材料50

2.2 田间试验50

2.3　供试菌系、菌液制备和接种鉴定51

2.5　分子标记辅助选择分析52

2.4 植株DNA的提取52

3 结果分析53

3.1 地谷抗稻瘟病基因的分子标记鉴定53

3.2　应用分子标记辅助选择聚合水稻抗稻瘟病基因55

4　讨论59

第5章 应用分子图谱定位水稻叶片性状和稻米品质的基因座位61

1 引言61

2　材料和方法62

2.1　试验材料62

2.2　田间试验62

3.1 叶片形态性状的QTL定位及其遗传效应分析63

3 结果分析63

2.3 分子图谱的构建和QTL定位63

3.2 稻米品质性状的QTL定位67

3.3　籽粒落粒性基因的定位69

4　讨论72

4.1 关于叶片性状的遗传和基因定位研究72

4.2　关于稻米品质的遗传和基因定位研究73

4.3　水稻籽粒的落粒性75

第6章　不同环境条件下数量性状定位的比较分析76

1 引言76

2.2　田间试验和农艺性状调查77

2.1　试验材料77

2　材料和方法77

2.3 分子图谱构建和QTL定位78

3 结果分析78

3.1 农艺性状在亲本间和DH群体中的表现78

3.2 农艺性状的QTL定位和不同环境条件下的比较研究81

4　讨论87

4.1 环境条件和遗传背景对QTL检测的影响87

4.2 相同性状的主效基因和主效QTL的关系89

4.3　相同或相邻染色体区段定位的QTL对相关性状的影响90

4.4　水稻和其它禾谷类作物QTL的比较作图90

参考文献93