图书介绍

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基于蛋白质相互作用网络的算法研究及其应用
  • 汤希玮著 著
  • 出版社: 北京:科学出版社
  • ISBN:9787030585714
  • 出版时间:2018
  • 标注页数:204页
  • 文件大小:29MB
  • 文件页数:215页
  • 主题词:蛋白质-基因组-研究

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图书目录

第1章 绪论1

1.1 蛋白质网络的计算分析1

1.1.1 蛋白质网络及其研究所面临的挑战1

1.1.2 蛋白质网络研究的具体内容4

1.2 蛋白质网络在疾病研究中的应用11

1.2.1 过滤方法13

1.2.2 文本和数据挖掘方法13

1.2.3 基于网络的方法15

1.3 本书的主要研究内容和框架19

1.3.1 分离静态蛋白质网络为不同时刻的动态网络20

1.3.2 关键蛋白质侦测算法20

1.3.3 蛋白质复合物挖掘算法21

1.3.4 疾病基因识别算法22

1.4 本书的结构23

1.5 本章总结24

第2章 动态蛋白质网络研究25

2.1 研究背景25

2.2 动态蛋白质网络构建方法27

2.2.1 数据集27

2.2.2 重构TC-PINs28

2.2.3 从TC-PINs中识别蛋白质复合物31

2.2.4 评价指标32

2.3 结果和讨论34

2.4 本章总结46

第3章 关键蛋白质研究48

3.1 研究背景48

3.2 关键蛋白质侦测算法WDC51

3.2.1 算法描述51

3.2.2 结果和讨论54

3.3 关键蛋白质侦测算法CNC72

3.3.1 算法描述72

3.3.2 结果和讨论77

3.4 关键蛋白质侦测算法SCP82

3.4.1 算法描述82

3.4.2 结果和讨论87

3.5 本章总结95

第4章 蛋白质复合物研究97

4.1 研究背景97

4.2 蛋白质复合物挖掘算法CMBI99

4.2.1 算法描述99

4.2.2 结果和讨论105

4.3 蛋白质复合物挖掘算法ClusterBFS122

4.3.1 算法描述122

4.3.2 结果和讨论126

4.4 本章总结135

第5章 基于蛋白质网络的疾病基因研究137

5.1 研究背景137

5.2 疾病基因识别算法PDMG141

5.2.1 算法描述141

5.2.2 结果和讨论144

5.3 疾病基因识别算法IMIDG150

5.3.1 算法描述150

5.3.2 结果和讨论154

5.4 本章总结160

第6章 结束语162

6.1 本书的主要贡献和创新点162

6.2 展望164

参考文献166

后记203

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